A CONTAG possui Coletivos Nacionais que correspondem às áreas de ação do MSTTR – políticas sociais, política agrária, política agrícola, comunicação, relações internacionais, finanças e administração, formação e organização sindical, meio ambiente, secretaria geral, presidentes(as) – e mais três Comissões Nacionais – mulheres trabalhadoras rurais, jovens trabalhadores(as) rurais e trabalhadores(as) rurais da terceira idade.
São compostos por diretores(as) da CONTAG e das FETAGs. Os objetivos das Comissões e Coletivos Nacionais são avaliar e propor novas ações e políticas para atender as demandas específicas das áreas. Normalmente as propostas são apresentadas e aprovadas na reunião do Conselho Deliberativo da CONTAG.